生物科学与技术学院的前身是生物化学教研室，2004年8月，学校从军队整体移交四川省政府，生物化学教研室隶属基础部，教师6人。

2005年12月，学校机构调整，成立了医学检验系，生物化学教研室划归其管理，教师13人。

2007年5月，为适应学科建设发展规律，生物化学教研室从医学检验系转归为基础医学院统一管理，教师16人。

2009年12月，成立生物医学系，下设办公室、学员队、生物化学教研室、细胞生物学和遗传学教研室、生物技术实验室，教师18人。

2012年7月，生物医学系机构调整，下设办公室、学员队、生物化学教研室、细胞生物学教研室、遗传学教研室、生物技术实验教学中心，教师24人。

2015年6月，去系办公室，改设教务学生科，成为现建制，教职员工32人。

2017年11月，生物医学系升级为生物科学与技术学院，教职员工37人。